【化学ソフトウエア学会無償利用ソフトウエア 内容説明】−分子科学−
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8029 INDO,MINDO/2
作成者:富永 信秀
勤務先:アデカ・アーガス化学(株)
勤務先住所:336 浦和市白幡5-2-13
使用機器:NEC PC-9801シリーズ、プリンター、ディスプレイ、N88BASIC-DISK-DOS
言語:N88BASIC
ファイル名:INDO.BAS, MINDO/2
[使用目的]
半経験的分子軌道法として
INDO法と、MINDO/2法の計算を行う。
[特徴]
プログラムはN88BASIC-DISK-DOSで記述されている。
固有値・固有ベクトルのプログラムは、ハウスホルダーQL法を採用している。ヤコビ法より高速である。
[備考]
[ダウンロードの前に]
ファイル名:8029.LZH.bin
ダウンロードしたらファイル名を8029.LZHに変更して下さい。
ファイルはLHAで圧縮されています。解凍にはLHA.EXEが必要です。
解凍したら、まず8029.DOCをご覧下さい。
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9205 PSIプログラム
作成者:木原 寛
勤務先:兵庫教育大学学校教育学部
勤務先住所:〒673-14 兵庫県加東郡社町下久米942-1
使用機器:NEC PC-9801シリーズおよび互換機、プロッタGraphtec DXY(無くても可)、プリ ンター、ディスプレイ、MS-DOS 2.11以上
言語:MS-FORTRAN ver4.1
ファイル名:
[使用目的]
[特徴]
本プログラムは、Wiliam L.
JorgensenによるプログラムPSI(電子密度ならびに波動関数のプロットのためのもの)をPC-9801シリーズで動作する一部書き直した移植版である。
PSI/77のプログラムには、STO-3Gと拡張ヒュッケル法に相当する基底関数が内蔵されているが、ここでは主として拡張ヒュッケル法により得られる分子起動を描く方法について説明する。
[備考]
[ダウンロードの前に]
ファイル名:9205.LZH.bin
ダウンロードしたらファイル名を9205.LZHに変更して下さい。
ファイルはLHAで圧縮されています。解凍にはLHA.EXEが必要です。
解凍したら、まず9205.DOCをご覧下さい。
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9217 MODEL(分子模型を描く)プログラム
作成者:木原 寛 、向井 邦彦、中野 英彦*
勤務先:兵庫教育大学学校教育学部 *姫路工業大学
勤務先住所:〒673-14 兵庫県加東郡社町下久米942-1
使用機器:NEC PC-9801シリーズ、プリンター(PC-PR201, PC-8821)、ディスプレイ
MS-DOS ver. 2.11以上
言語:N88BASIC(86) ver.3.0
ファイル名:
[使用目的]
[特徴]
本プログラムは、構造化学、有機立体化学などの学習・研究に利用することを目的として改良を加えたもので、つぎのような機能を持つ。
(1)球棒型分子模型ならびに空間充填分子模型の画面への図示
(2)針金型模型による簡易回転アニメーション
(3)アニメーション画像の表示と回転アニメーション画像の自動作成
(4)多重露光による高画質写真撮影
[備考]
マニュアルは、ディスク内に「一太郎 Ver. 4」の文書ファイルとして入っている(A4版14頁)。
[ダウンロードの前に]
ファイル名:9217.LZH.bin
ダウンロードしたらファイル名を9217.LZHに変更して下さい。
ファイルはLHAで圧縮されています。解凍にはLHA.EXEが必要です。
解凍したら、まず9217.DOCをご覧下さい。
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9222 3次元初期座標作画「3次元の王子様」
作成者:赤木 俊夫
勤務先:石原産業(株)中央研究所
勤務先住所:510 四日市市石原町1
使用機器:NEC PC-9801シリーズ(PC-9801VMで使用実績)、プリンター
ディスプレイ(アナログRGB)、MS-DOS ver. 2.11以上、CTOOL98(2.0)
言語:Lattice C (J3.1)
ファイル名:
[使用目的]
[特徴]
パソコンを用いた分子設計の研究を行う上で、思い通りの入力座標の作成のために「3次元の王子様」を開発した。その特徴は、なるべく数字や化学的用語を用いず、マウスとキーボードとを使って対話形式で適切な入力座標が得られることである。
通常よく用いられる入力座標作画プログラムは次の2つをベースにしている。
(1)登録されたフラグメントを繋いでいく
(2)捻れ回転によって目的とするコンフォメーションを得る。
[備考]
[ダウンロードの前に]
ファイル名:9222.LZH.bin
ダウンロードしたらファイル名を9222.LZHに変更して下さい。
ファイルはLHAで圧縮されています。解凍にはLHA.EXEが必要です。
解凍したら、まず9222.DOCをご覧下さい。
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9005 CNDO/2 (MOLDA, MOLMOL対応版)
作成者:若杉 一行
勤務先:保土谷化学工業(株)筑波研究所
勤務先住所:305 つくば市御幸が丘45
使用機器:NEC PC-9801シリーズ、プリンター、ディスプレイ、MS-DOS
言語:N88BASIC(86)
ファイル名:CNDO2-1.BAS
[使用目的]
[特徴]
分子軌道法計算ソフトCNDO/2 で必要なデータは、MOLDA
のデータファイル(*.DAT)に揃えている。
CNDO/2は、H, C, N, O, F
の元素にしか対応していないが、初学者には十分であろうと思われる。
また、計算結果を、MOLMOLに対応したファイル(*.MOL)として出力するようにしたので、MOLMOLで分子軌道をグラフィックすることができる。
[備考]
(発表誌) 会報JAPC, vol.8, No.2, p.79(1986)
MOLDA:
小川桂一郎、吉田弘、鈴木弘「分子のモデリングと分子力場計算入門」
(株)サイエンスハウス
MOLMOL:
平野恒夫、村谷宏明、簡易迅速分子軌道表示プログラム、第2回化学PC
ソフトウェア研究討論会講演要旨集
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7071
ソフトウエア名:GMOLMシステム(ver.8)
作成者:大崎 健次
勤務先:京都大学名誉教授
勤務先住所:569 高槻市南平台5-9-6
使用機器:NEC PC-9801シリーズ
プリンター
MS-DOS
言語:N88BASIC(86)
ファイル名:GMOLM
[使用目的]分子科学
与えられた結晶構造を自分で吟味するためのプログラム。とくに、分子間の接触や水素結合の検討に便利なように作ってある。
結晶構造データの利用およびそのチェック。CIF-ファイルの出力
[特徴]
(Ver.5)
このプログラムは、結晶構造データ(格子定数、対称操作コード、原子名と原子座標)をもとにして結晶構造および分子構造を再編成し、分子内の結合角およびねじれ角表示(およびプリント)するほか、隣接分子間の接触距離のリストおよび水素結合の可能性のある原子の組のリストを表示(およびプリント)する。また個々の分子の構造およびその分子と接触するすべての隣接原子を任意の方向に投影して図示する。
(Ver.7)
結晶構造データに対するチェック機能が強化されたほか、標準偏差の入力・利用も可能となった。
入力データとしては、従来のSTD形式の他に、Acta
Crystallographica C への投稿に使用されるCIF-形式データの入・出力およびSTDデータとの相互変換が可能になった。 (Ver.8)
分子の構成が不完全なままで終わる場合がある不具合を解消した。金属原子を含む場合の使用上の注意を追加した。分子再構成プログラムMOLEC.BASとその説明を追加した。
[備考]
化学とソフトウエア、17巻4号225-239 (1995)
[ダウンロードの前に]
ファイル名:7071.LZH.bin
ダウンロードしたらファイル名を7071.LZHに変更して下さい。
ファイルはLHAで圧縮されています。解凍にはLHA.EXEが必要です。
解凍したら、まず7071.DOCをご覧下さい。
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9506
ソフトウエア名:EDCIFシステム
作成者:大崎 健次
勤務先:京都大学名誉教授
勤務先住所:569 高槻市南平台5-9-6
使用機器:NEC PC-9801シリーズ、ディスプレイ、ファイル取扱装置
MS-DOS
言語:N88BASIC(86)
ファイル名:EDCIF
[使用目的]分子科学
結晶構造データの流通および学会誌への投稿のためのCIF-ファイルの作成を支援する。
[特徴]
ディスプレイの画面上に表示される質問に答えて、キーボードから数値データ、文字列、テキスト文などを入力すれば、ひとりでにCIF-文法をみたすCIF-ファイルが生成し、指定のファイルに出力できる。
一度に全部を入力する必要はない。すぐに答えられぬ項目はスキップしたり、途中で入力を中断して出来た分だけをファイルに出力し、後日これを読み込んで、入力を続行し、完成させる、ということもできる。
[備考]
[ダウンロードの前に]
ファイル名:9506.LZH.bin
ダウンロードしたらファイル名を9506.LZHに変更して下さい。
ファイルはLHAで圧縮されています。解凍にはLHA.EXEが必要です。
解凍したら、まず9506.DOCをご覧下さい。
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XXXX
[使用目的]
[特徴]
[備考]
[ダウンロードの前に]
ファイル名:XXXX.LZH.bin
ダウンロードしたらファイル名をXXXX.LZHに変更して下さい。
ファイルはLHAで圧縮されています。解凍にはLHA.EXEが必要です。
解凍したら、まずXXXX.DOCをご覧下さい。
ダウンロード?→(Yes/No)
XXXX
[使用目的]
[特徴]
[備考]
[ダウンロードの前に]
ファイル名:XXXX.LZH.bin
ダウンロードしたらファイル名をXXXX.LZHに変更して下さい。
ファイルはLHAで圧縮されています。解凍にはLHA.EXEが必要です。
解凍したら、まずXXXX.DOCをご覧下さい。
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