World Wide Web (WWW)上で３次元グラフィックスを行うための新しいテクノロジーである Virtual Reality Modeling Language (VRML)が、1995年以降、急速に発展してきた。 最近では、もっとも普及しているWWWブラウザである、Netscape NavigatorにもVRML Viewer が標準的に添付されるようになり、VRMLを用いた3Dグラフィックスが急速に普及してきている。 そこで本研究では、VRMLを分子グラフィックスの分野に応用することを目的として、 1984年に開発した、分子構造データ作成プログラムMOLDA4[1,2] をWindows95/NTに移植すると同時に、 作成された分子構造データをVRML形式のファイルに変換し、Netscape Navigator等のWWWブラウザを 用いて分子グラフィックスを可能とする機能を追加したMOLDA for Windowsを開発したので報告する。

２．１ 分子構造データ作成機能

分子構造データの作成機能は、MOLDA4と大きな違いはないが、マウスを用いることにより操作性が向上した。 分子構造データの作成方法としては、分子同士の接続（縮環機能を含む）、置換基接続、対称操作 による対称構造の生成などがある。また、読み書き可能な三次元座標データの形式は、 XMol形式[3]またはMODRAST/MOLDA形式[4]である。

２．２ 分子科学計算プログラムとのインターフェイス機能

MOLDA for Windowsは、非経験的分子軌道計算プログラムGAUSSIAN94、分子力場計算プログラム MM2の入力データを作成すると同時に、出力結果をMOLDAのデータとして取り込むことができる。 また、分子動力学計算プログラムAMBER4の計算結果を読み込み、シミュレーション結果の動画表示も可能である。

２．３ VRMLによる分子グラフィックス機能

MOLDA for Windowsで作成された分子の三次元座標値はVRMLの形式に変換することが可能である。 表示可能な分子模型図には、Stick模型（図１）、球棒模型（図２）、空間充填型模型（図３）がある。 また、これらの分子模型図では、マウスを用いることにより視点を移動させることが可能である。 さらに、作成されたVRMLファイルに命令を追加すれば、アニメーション等を実行することができる。

図１ 18-Crown-6のStick模型図 （ここをクリックするとVRMLで表示される）

図２ 18-Crown-6の球棒模型図 （ここをクリックするとVRMLで表示される）

図３ 18-Crown-6の空間充填型模型図 （ここをクリックするとVRMLで表示される）

MOLDA for Windowsでは、使用可能なOSがMicrosoft Windowsに限られているが、このプログラムの VRML形式への変換機能の部分については、Java言語にも移植しており下記URLより提供している。 さらに、プログラムの全ソースリストも下記URLより公開している。

http://cssj.chem.sci.hiroshima-u.ac.jp/molda/molda.htm

[1]K.Ogawa,H.Yoshida,H.Suzuki,J.Mol.Graphics,2(4),113(1984).
[2]小川，吉田，鈴木，「パソコンによる分子のモデリングと分子力場計算入門」， サイエンスハウス（１９８６）．
[3] Minnesota Supercomputer Center, Inc., XMol (Version 1.5) User Guide
[4]「実践パソコン・分子科学計算」，サイエンスハウス（１９９２）．